SAMtools 설치

Tools/Bio Tools / / 2012. 6. 4. 15:22
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다운로드 : http://sourceforge.net/projects/samtools/files/

설치 :

# cd /usr/local/src

# wget http://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/0.1.18/samtools-0.1.18.tar.bz2/download

# tar jxvfp samtools-0.1.18.tar.bz2 

# cd samtools-0.1.18

# make

# mkdir -p /usr/local/bam/lib

# mkdir -p /usr/local/bam/include/bam

# cp libbam.a /usr/local/bam/lib/

# cp *.h /usr/local/bam/include/bam/

# mv /usr/local/src/samtools-0.1.18 /usr/local

# echo "export PATH=/usr/local/samtools-0.1.18/:\$PATH" >> /etc/profile

# source /etc/profile

# which samtools

/usr/local/samtools-0.1.18/samtools

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