[R] R 설치

# yum -y install libpng libpng-devel libtiff libtiff-devel libjpeg-turbo libjpeg-turbo-devel readline-devel bzip2-devel libcurl-devel cairo-devel

# cd /BiO/src

# wget http://cran.nexr.com/src/base/R-3/R-3.3.0.tar.gz

# tar zxvfp R-3.3.0.tar.gz

# cd R-3.3.0/

# ./configure --prefix=/BiO/R-3.3.0 --enable-R-shlib --with-libpng --with-jpeglib --with-libtiff --with-x

# make && make install

# /BiO/R-3.3.0/bin/R

> capabilities()

       jpeg         png        tiff       tcltk         X11        aqua 

       TRUE        TRUE        TRUE       FALSE        TRUE       FALSE 

   http/ftp     sockets      libxml        fifo      cledit       iconv 

       TRUE        TRUE        TRUE        TRUE        TRUE        TRUE 

        NLS     profmem       cairo         ICU long.double     libcurl 

       TRUE       FALSE       FALSE       FALSE        TRUE        TRUE 

※ 클러스터 시스템에서 아래과 같은 에러가 발생 시..

: unable to start device PNG

=>

master# vi test.r

#!/BiO/R-3.3.0/bin/Rscript

options(bitmapType="cairo")

....

....

....

dev.off()

# /BiO/R-3.3.0/bin/Rscript test.r